你好！关于城中村拆迁补偿的问题，通常会涉及到土地使用权、房屋产权以及户口等多个因素。根据你提供的信息，你的父母在1994年离婚时已经对自建房进行了分割，并且各自拥有房产证，这意味着你们家庭内部的产权分配是明确的。

在这种情况下，拆迁补偿通常会按照房产证上的登记情况来进行。既然房产证上分别登记了你父母的名字，那么拆迁补偿应该也会相应地分为两个部分，分别对应你父母各自的份额。因此，从法律角度来看，拆迁补偿应该是按照两户来进行赔偿，而不是一户。

不过，具体的补偿方案还需要考虑当地的拆迁政策和法规。不同地区可能会有不同的规定，例如是否需要考虑户口因素、是否有其他附加条件等。因此，建议你咨询一下当地负责拆迁工作的相关部门或聘请专业律师进行详细咨询，以获取更准确的信息和专业的法律意见。

希望这个回答对你有所帮助！如果还有其他具体问题，欢迎继续提问。