自动离职是指员工未按照规定提前通知用人单位，自行离开工作岗位的情况。在中国的劳动法律法规中，并不会因为员工自动离职而完全剥夺其应得的工资。

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，即使员工自动离职，只要他在离职前付出了劳动，那么他仍然有权获得对应工作期间的劳动报酬。

对于您的情况，如果员工在离职时尚未结清工资周期内的工资，那么工厂应当依法结算并支付这20多天的工资。但也要注意，若因自动离职给工厂造成损失且依据劳动合同或单位规章制度有相应扣除条款时，可能会在一定程度上影响到实际可领取的工资金额。具体问题建议结合劳动合同、内部规章制度以及与工厂的沟通协商来处理。